地元の有益な土壌細菌を使用して作物の病気と戦う革新的な方法は、科学と産業の協力から生まれました。
ジョンイネスセンター(英国)の科学者チームは、農場の敷地から収集した土壌から数百株のシュードモナス菌を分離してテストし、そのうち69株のゲノムを配列決定しました。
チームは、病原菌の活動を阻害する菌株と阻害しない菌株のゲノムを比較することにより、ジャガイモ作物を有害な細菌から保護するための重要なメカニズムを特定することができました。
次に、化学と遺伝学の組み合わせと一連の実験を使用して、科学者は、環状リポペプチドと呼ばれる小分子の生成がジャガイモのかさぶた(ジャガイモの作物に重大な損傷を引き起こす細菌性疾患)を制御するのに重要であることを示しました。 これらの小分子は、病原性のかさぶたの原因となる細菌に対して抗菌効果があり、有益なシュードモナス菌が植物の根に移動してコロニーを形成するのを助けます。
実験はまた、灌漑が土壌中のシュードモナスの遺伝的に多様な個体群に有意な変化を引き起こすことを示しました。
eLifeで公開されたこの研究は、科学者がフィールドのほぼすべての領域のマイクロバイオームを研究し、さまざまな土壌、農薬、環境条件を考慮に入れることができる方法を提供します。
科学者は、高速遺伝子シーケンシングの進歩を利用して、土壌微生物叢の有益な細菌をテストし、病原体を抑制するためにどの分子が生成されるかを判断できます。 次のステップは、有益な微生物を繁殖させて同じ分野に戻すことです。
微生物叢エンハンサーの潜在的な用途には、塊茎の表面にスプレーとして、または点滴灌漑を使用して土壌に直接バクテリアカクテルを適用することが含まれます。